Bioinformatique et Séquençage Haut-Débit
Colloque, Date: 24 mars 2010, Lieu: Paris
Annonce
Les technologies de séquençage à haut-débit (SHD) révolutionnent de
nombreuses approches expérimentales en biologie moléculaire et
évolutive. Leurs applications couvrent des domaines aussi divers que
la génomique, l'épigénomique, la transcriptomique, ou encore la
métagénomique. Ces applications génèrent toutes des quantités
impressionantes de séquences courtes (reads en anglais), et exigent
des traitements bioinformatiques spécifiques, aussi fiables
qu'efficaces.
L'objectif de ce colloque est de présenter l'état de l'art dans divers
domaines d'applications, ainsi que les questions ouvertes qui se
posent pour le futur.
Nous vous invitons donc au colloque "Bioinformatique et Séquençage
Haut-Débit" qui se déroulera à Paris le 24 mars 2010 à l'Ecole Normale Supérieure de Paris.
Ce colloque est organisé sous l'égide du GDR Bioinformatique
Moléculaire et du réseau ReNaBi (Réseau National de Bioinformatique)
et de la Société Française de Génétique.
Orateurs confirmés
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Jean-Jacques Daudin, AgroParisTech, Paris
Statistical challenges from the analysis of NGS-Metagenomics experiments
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Hughes Richard, Univ. Pierre et Marie Curie, Paris,
Detection and Annotation of Alternative splicing events with RNA-Seq data
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Roderic Guigo, CRG, Barcelone,
Discovery and quantification of RNA by RNAseq experiments
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Gunnar Raetsch, Max Planck Institute, Tübingen,
Machine Learning Methods for RNA-seq-based Transcriptome Reconstruction
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Valentina Boeva, Curie, Paris,
Prediction of transcription factor binding sites from ChIP-Seq data through de novo TFBS motif discovery
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Gregory Kucherov, CNRS/LIFL and INRIA, Lille,
Seed design framework for mapping AB SOLiD reads
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Richard Christen, Univ. Nice,
Analyses de la biodiversité microbienne grâce au séquençage massif des séquences d'ARN ribosomiques. Résultats & problèmes.
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Jean Marc Aury, Centre National de Séquençage, Evry,
Les nouvelles technologies de séquençage au Genoscope: assemblage et annotation de génomes
Comité d'organisation
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Eric Rivals, LIRMM - CNRS, Univ. Montpellier II
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Emmanuel Barillot, Institut Curie, Paris
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Stéphane Robin, INRA - AgroParisTech, Paris
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Hugues Roest Crollius, ENS, Paris
Financeurs
Ce colloque est financé et soutenu par :
Informations pratiques
Site: http://www.lirmm.fr/~rivals/SHD-2010
L'inscription est gratuite mais obligatoire ; le repas est à la charge des participants. Pour
vous inscrire envoyer le formulaire suivant (au format .txt) SHD-form.txt à
Elisabeth.Greverie_AT_lirmm.fr
(remplacer AT par @).
Author: Eric Rivals
<rivals_AT_lirmm.fr>
Date: 2010/03/29 16:28:33